Пробиотикът се използва, за да даде на организма така наречените „добри” бактерии. Всъщност нашето тяло може да се определи като една микролаборатория, в която има налични бактерии, вируси и гъбични образования, които са както „добри”, така и „лоши”.
Когато „добрите” бактерии намалеят или се отслаби тяхната сила, ние се разболяваме. Обичайно, когато сме болни, взимаме антибиотик, който е предписан от нашия лекар, но той поразява с действието си не само причинителите на болестта, но и някои „добри” бактерии. В този момент идва приложението на пробиотика, чиято цел е да подсили „добрите” бактерии.